生物工程专业培养目标是使学生掌握生物工程专业的基础理论、基本知识和基本技能，具备从事生物工程设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发能力的中、高级应用型人才。学生毕业后能够在科研机构、高等学校及企事业单位、政府部门从事生物工程相关的科研、教学、开发、营销及管理等工作，也可以继续深造，攻读硕士学位。

本专业开设的课程主要有：基础化学、有机化学、基础生物学、生物化学、微生物学、发酵工程、基因工程、生化工程设备、生物分离工程、细胞工程、酶工程、生物反应工程、发酵工厂设计、分子生物学、生物工艺学等。

本专业学制四年，授工学学士学位。