生物医学工程专业设立于2018年，2020年开始招生。本专业依托常州大学化学、材料、机械、电子信息等优势学科，面向长三角地区医疗器械行业发展需求，下设生物医学仪器和生物医学材料两个方向，贯彻“宽基础、强能力、重应用、突出创新”的培养方针，着力培养具有扎实的数学、物理学、生物医学及工程技术基础，掌握重要的生物医学工程知识，拥有独立思辨能力、开拓和创新精神，能在疾病的诊断、预防、治疗和康复等邻域的医疗器械研发和管理提供工程技术支持的高素质创新型技术人才。

专业现有专任教师17人，其中包括美国医学与生物工程院（AIMBE）会士1人、江苏省特聘教授2人、江苏省第六期333工程第三层次人才1人、江苏省双创博士1人、常州市青年科技托举人才1人。

近年来专业教师主持国家自然科学基金重点项目1项、国家自然科学基金面上项目5项、国家自然科学基金青年项目4项，其余省市级项目十余项，发表科研论文90多篇，其中包括国际著名顶刊《PNAS》、《Science Translational Medicine》等。